进水水量
我国城市污水处理厂进水不足的现象十分普遍,这是由于污水收集网建设滞后以及设计能力问题造成的。这两个原因导致许多地方污水处理厂已经建成多年仍然不能完全运行，一些污水处理厂只能提取周边河道水处理，这使污水处理过程控制更加困难，也增加了工程投资成本，造成资产闲置和浪费，不必要的过度消耗已经非常紧张的污水处理资金。
比较之下，一些污水处理厂具备长期性负载运作情况，如污水处理厂一期工程等级为四十万m3/d，二期工程经营规模为24万m3/d，但因为资金不足，二期工程基本建设落后，一期工程项目具体产出量达52万m3/d，解决水体降低。因此，合理确定污水处理厂建设规模和阶段，有效利用污染控制资金，最大限度地提高污水收集率，是减少污水排放的前提。

进水水质
污水收集管网不匹配，雨水污水联合流量控制网络较为普遍，管网管理不到位，导致大量雨水、河水和工业废水进入城市污水处理厂。
下列水质条件不利于污水处理厂的正常运行:
1.进水里的淤泥和银鳕鱼含量小于设计方案值，氮、磷等指标值相当于或高过设计方案值，因而废水中的氮、磷较难除去。
2.工业废水中的污染和有毒物质对城市污水处理厂的生物系统有很大的影响，在极端情况下这些污染和有毒物质使整个生物系统瘫痪，微生物菌种死亡，污水处理厂必须重新培养活性污泥
3.进水水质偏高，供氧与污泥脱水设备规格不能满足污水与污泥处理要求。垃圾渗滤液对城市污水处理站运作的危害最该高度重视。
由于污水收集与污水处理能力之间缺乏协调,有关部门必须在近期和长期将城市排水管网和污水处理厂的建设纳入城市建设规划。同时,新的污水处理厂在污水质量的使用范围内,以合理确定水质的设计。
出水水质
我国近年来建成的城市污水处理厂的基本要求符合gb18918-2002年国家标准b，某些地区也符合标准a。甚至最初的项目也在升级，以提高污水减排的效率。
根据污水处理排放标准的要求,城市污水处理厂采用适合当地水质和其他客观条件的污水处理技术,加强运行管理。然而，在污水处理厂的实际运行管理过程中，仍会遇到一些来自不同方面的问题而导致处理出水水质不达标。

1.有机物超标
传统活性污泥法的主要效果是去除城市污水中的有机污染物，设计和运行良好的活性污泥法。
影响治疗效果的主要因素是：
1.营养物
城市污水中的氮、磷和其他营养素可以满足微生物的需要，并且可以大量过剩。但工业废水所占比例较大时，应注意核算碳、氮、磷的比例是否满足100:5:1。假如废水中欠缺氮，一般会添加铵盐。如果污水中磷很少,通常可以加磷酸或磷酸盐。
2.pH
城市污水的pH值一般为6.57.5。正是由于城市污水运输管道中的厌氧发酵断裂的PH值稍低可能是雨季ph值的减少往往是由城市酸雨引起的，在联合流量系统中尤为突出。正是由PH突变的，不论是升降还是降低，通常都是工业废水排放量大。这调整污水的pH值,通常是氢氧化钠或硫酸,大大提高了污水处理的成本。
3.油脂
当污水含油量较高时，曝气设备的曝气效率会降低，若不增加曝气量，则处理效率会降低。确保污水中高脂肪含量也降低活性污泥的沉降性能，严重时候污泥膨胀的原因，水标。对于含油量高的水，需要在预处理段加入。

4.温度
温度对活性污泥加工工艺的危害挺大。首先，温度会影响活性污泥中微生物的活性，如果冬季温度较低，处理效果会降低。其次，温度的变化会影响二次沉淀池的分离性能，如温度的变化会导致沉淀池产生异常重流，导致短流；温度的降低会导致活性污泥由于粘度的增加而降低沉淀性能；温度的变化会影响曝气系统的效率。当夏季温度升高时，由于溶解氧饱和度的降低，曝气效率降低，空气密度降低；如果不改变空气供应，则必须增加空气供应。
2.氨氮超标
根据污水中氨氮的去除主要是根据传统的活性污泥法技术采用硝化技术，延时呼吸，降低系统的负荷。
造成废水氨氮过剩的原因主要有以下几个方面：
1.污泥负荷与污泥龄
生物硝化是一种低负载全过程,F/m一般是0.050.15kgBOD/kgMLVS。负荷越低，硝化进行得越充分，NH3-N向NO3--N转化的效率就越高。与低负载对比，生物硝化系统中的srt较长，由于硝化细菌的转化成周期时间较长，假如生物系统中的淤泥停留時间过短，即污泥沉降比过低，没法塑造硝化细菌，没法做到硝化反应实际效果。SRT控制在多少，取决于温度等因素。针对以脱氮为关键目地的生物系统，强烈推荐应用srt11-23天。
2.回流比
生物硝化系统的回流大于传统活性污泥工艺，主要是由于生物硝化系统活性污泥混合物中硝酸盐含量大。通常回流比控制在50～100%。
3.水力停留时间
生物硝化反应水解酸化池的水力停留時间比曝气生物滤池长。这关键是由于硝化反应速度远远地小于有机化学空气污染物的除去速度，因而必须更长的反应时间。
4.BOD5/TKN
TKN是水里有机化学氮和高锰酸盐指数之和，注入废水中BOD5/TKN是危害硝化反应实际效果的关键要素。活性污泥中硝化细菌比例越小，硝化速率越小，相同操作条件下硝化效率越低。通过多家城市污水处理厂的运行实践表明，Bod5/tkn的最佳处理范围约为23。
5.硝化速率
生物硝化系统的一个特殊加工工艺主要参数是硝化反应速度，即每日由活性污泥法转换为企业净重的高锰酸盐指数量。硝化速率的大小取决于活性污泥中硝化细菌所占的比例，温度等很多因素，典型值为0.02gNH3-N/gMLVSS×d。
6.溶解氧
硝化细菌是一种有氧细菌，它能阻止无氧生存，硝化细菌的吸氧速率远低于分解有机体。因而，必须维持微生物池好氧地域的溶解氧在1mg/l之上，在特殊情况下融解co2的含量也必须提升。
7.温度
硝化细菌对温度变化敏感，污水温度低于15℃时硝化速度显着降低，污水温度低于5℃时生理活动完全停止。因此，冬季时污水处理厂特别是北方地区的污水处理厂出水氨氮超标的现象较为明显。
8.pH
硝化细菌对pH反映很敏感，在pH为8～9的范围内，其生物活性最强，当pH<6.0或>9.6时，硝化菌的生物活性将受到抑止并趋于停止。正因如此，尽量控制生物硝化系统的混合液PH在7.0以上。